Vier Jahre sind seit dem Desaster im Jurassic Park auf Isla Nublar vergangen. Auf der nahgelegenen Insel Isla Sorna, der ehemaligen Zuchtstätte aber haben verschiedene Saurierarten überlebt. 

Der Jurassic-Park-Gründer John Hammond möchte sein Gewissen erleichtern. Der Milliardär plant eine Gruppe von Experten nach Isla Sorna zu schicken, die das Leben der Saurier dort dokumetieren und die Welt davon überzeugen sollen, dass auch diese Tier ein Recht auf Schutz und ein artgerechtes Leben haben. 

Doch Hammonds Neffe Peter Ludlow, der mittlerweile die Führung über InGen innehat, hat andere Pläne. Er beabsichtigt, verschiedene Saurierarten einzufangen und nach San Diego zu verschiffen, wo er einen neuen Jurassic Park gründen will.